Усн 6% и ндс

Автор: | 29.12.2018

Консультант пульс

всегда в курсе событий

НДС на УСН: что нужно помнить

Откуда может взяться НДС при «упрощенке»

В общем случае, плательщик УСН, действительно, освобождается от перечисления НДС в бюджет. Основание – пункты 2 и 3 статьи 346.11 Налогового кодекса.

Но в этом правиле есть исключения.

Так, например, указанное положение не распространяется на (ст. 174.1, п. 2 и п. 3 ст. 346.11 НК РФ):

· НДС при осуществлении операций по договору простого товарищества (договору о совместной деятельности);

· налог при осуществлении деятельности по договорам доверительного управления имуществом;

· НДС при реализации концессионных соглашениях на российской территории.

Имейте в виду: подробнее с вопросом можно ознакомиться, например, в письме Минфина России от 2 марта 2011 г. № 03-07-11/38.

Более того, если УСН-щик приобретает товары, работы или услуги у хозяйствующего субъекта, который применяет общую систему налогообложения, то он платит НДС продавцу вместе со стоимостью соответствующего наименования.

Если же плательщик УСН сам выставляет счет-фактуру с выделенным НДС, то он должен уплатить его сумму в бюджет. Основание – подпункт 1 пункта 5 статьи 173 Налогового кодекса. Налоговая служба также указывает на это в письме от 8 июня 2011 г. № ЕД-20-3/690.

Причем по перечисленным в бюджет денежным средствам налогоплательщику придется отчитаться в свою инспекцию. А именно: представит декларацию по НДС за тот квартал, в котором УСН-ком были выставлены счета-фактуры. Об этом говорит пункт 5 статьи 174 Налогового кодекса.

Обратите внимание: с 1 октября прошлого года плательщики УСН по письменному согласованию с контрагентом имеют право не выставлять счет-фактуру. Такое нововведение было внесено Федеральным законом от 21 июля 2014 г. № 238-ФЗ. По данному вопросу полезно ознакомиться также с тематическими письмами Минфина России от 8 сентября 2014 г. № 03-11-06/2/44863 и от 5 сентября 2014 г. № 03-11-06/2/44783.

Применение УСН никак не освобождает плательщика единого налога от обязанностей налогового агента. Это правило распространяется и на НДС – статья 161 и пункт 5 статьи 346.11 Налогового кодекса.

Как учесть НДС при расчете единого налога

Порядок налогового учета сумм НДС определен такими нормативами как:

Выручка от реализации определяется по всем поступлениям от реализации товаров, работ и услуг – пункт 2 статьи 249 Налогового кодекса.

Таким образом, с точки зрения формального подхода, получается, что даже тот НДС, который подлежит уплате в бюджет, должен учитываться плательщиком УСН в качестве дохода. Именно этой позиции придерживает Минфин России – смотрите, например, письма от 21 сентября 2012 г. № 03-11-11/280 и от 11 января 2008 г. № 03-11-05/02.

Но если у предпринимателя или организации есть время и желание (т.е. цена вопроса достаточно велика) наведаться в суд, то есть все шансы отстоять свою позицию. Ведь арбитры признают правомерным возможность включения в состав налогооблагаемых доходов «очищенной» от НДС выручки. Как справедливо считают судьи, уплачиваемый в бюджет налог не является экономической выгодой налогоплательщика. Следовательно, рассматривать его сумму как доход не нужно. Данные выводы содержат, в частности:

Напомним, что плательщики УСН должны вести учет доходов и расходов для целей исчисления базы по единому налогу в специальной книге, чьи форма и порядок заполнения утверждены приказом Минфина России от 22 октября 2012 г. № 135н.

Однако многие плательщики УСН с объектом налогообложения «доходы минус расходы» могут захотеть пойти дальше и попытаться записать сумму НДС, уплаченного в бюджет, себе в расходы. В этом случае, претензии налоговиков практически гарантированы. Тем более что «начальство» их в этом вопросе всецело поддерживает – смотрите, например, письмо Минфина России от 21 сентября 2012 г. № 03-11-11/280.

Основной довод налоговых органов – плательщик УСН освобожден от уплаты НДС действующими нормами налогового законодательства. И, соответственно, данный фискальный платеж не может быть учтен в расходах закрытого перечня пункта 1 статьи 346.16 Налогового кодекса.

Что касается «входного» НДС, то здесь проблем нет и для плательщиков УСН с объектом «доходы минус расходы» его сумма является расходом, который учитывается при исчислении единого налога. Основание для этого предоставляет подпункт 8 пункта 1 статьи 346.16 Налогового кодекса.

«Ввозной» НДС, который импортеры уплачивают в казну на таможне, также ничто не мешает учесть при исчислении суммы единого налога, уплачиваемого при применении «упрощенки». Положения об этом содержат подпункт 3 пункта 1 статьи 70 Таможенного кодекса Таможенного Союза и подпункт 11 пункта 1 статьи 346.16 Налогового кодекса.

Имейте в виду: сумма налога не подлежит включению в стоимость приобретенных ценностей и отражается в книге учета доходов и расходов отдельной строкой. Исключения – операции по приобретению плательщиком УСН основных средств или нематериальных активов. Об этом говорят подпункт 3 пункта 2 статьи 170 Налогового кодекса, пункт 3 статьи 346.16 Налогового кодекса, пункт 8 ПБУ 6/01 и пункт 8 ПБУ 14/2007, утвержденные приказами Минфина России от 30 марта 2001 г. № 26н и от 27 декабря 2007 г. № 153н соответственно. Помимо этого, полезная информация по вопросу содержится, например, в письме Минфина России от 18 января 2010 г. № 03-11-11/03.

Важным моментом также является то, что, несмотря на отражение информации по НДС отдельной строкой, его учет ведется в порядке, аналогичном стоимости приобретенных товаров (работ, услуг). Так, например, налог по товарам для перепродажи необходимо включать в расходы по мере реализации таковых – подпункт 2 пункта 2 статьи 346.17 Налогового кодекса. Минфин России указывал на это, в частности в письме от 17 февраля 2014 г. № 03-11-09/6275.

Может ли плательщик УСН принять НДС к вычету?

На этот вопрос налогового учета, в отличие от других, уже приводившихся выше, можно дать однозначный ответ – нет, нельзя.

Ведь УСН-щик не является плательщиком НДС. Поэтому и принять «входной» налог к вычету у него не получится. При этом не имеет значения – выставлялся ли им в соответствующем периоде счет-фактура с выделенной суммой налога или нет.

Даже высшие судьи подтвердили такой подход в постановлении Пленума ВАС РФ от 30 мая 2014 г. № 33.

Арбитры справедливо указали, что статуса плательщика НДС в рассматриваемой ситуации не возникает. А значит, у налогоплательщика не появляется права и на применение налоговых вычетов. Положениями главы 21 основного налогового документа не предусмотрено возможности уменьшения налога, уплачиваемого на основании подпункта 1 пункта 5 статьи 173 Налогового кодекса, на какие-либо вычеты.

Как работать с НДС на упрощенке?

Операции упрощенца НДС не облагаются на основании чего?

Хозяйственные операции при УСН не облагаются НДС на основании положений пп. 2 и 3 ст. 346.11 НК РФ. Но это не значит, что упрощенцы не могут вступать в правоотношения, которые сопровождаются появлением обязанностей, характерных для плательщика НДС.

Можно ли на УСН работать с НДС? Безусловно. Обязанности, связанные с исчислением и уплатой данного налога, у упрощенца могут возникнуть в связи с тем, что он:

  • формирует счета-фактуры с выделенным НДС;
  • становится налоговым агентом по НДС;
  • осуществляет импорт товаров или услуг (такие правоотношения предполагают уплату импортером НДС в любом случае);
  • платит НДС, находясь в составе товарищества (и имея полномочия по контролю над хозяйственными операциями, которые облагаются НДС).

Изучим данные сценарии подробнее.

Кто платит при упрощенной системе налогообложения НДС: выставлен счет-фактура?

Формировать счета-фактуры с выделенным НДС плательщики УСН имеют полное право. Обычно выставление таких документов обусловлено просьбами контрагентов, которые желают включить отраженные в них суммы НДС в вычеты.

Выставив счет-фактуру с НДС, упрощенец будет обязан уплатить соответствующий налог до 25 числа месяца, что идет за кварталом, в котором выдан счет-фактура. Кроме того, нужно будет в аналогичный срок сдать в ФНС декларацию по НДС (п. 5 ст. 174 НК РФ).

Отметим, что «исходящий» НДС фирма на УСН не сможет уменьшить на сумму вычета за счет полученных «входящих» НДС (п. 5 постановления Пленума ВАС РФ от 30.05.2014 № 33). При этом полученная по контрактам с НДС выручка включается в доходы по УСН без НДС (письмо Минфина России от 21.08.2015 № 03-11-11/48495).

Упрощенец как налоговый агент: как платится НДС?

Хозяйствующий субъект на УСН может быть налоговым агентом — лицом, обязанным уплатить НДС за другой хозяйствующий субъект. Это возможно, если:

  1. Хозяйствующий субъект на УСН арендует или покупает имущество, принадлежащее государству. При этом если по договору аренды или купли-продажи цена указана без НДС, то налог «упрощенец» обязан самостоятельно исчислить и уплатить (п. 3 ст. 161 НК РФ).
  2. Упрощенец работает в России как посредник иностранной организации, не поставленной на налоговый учет в РФ (п. 5 ст. 161 НК РФ).
  3. Плательщик УСН реализует конфискованное имущество. Аналогично налог в этом случае начисляется и уплачивается упрощенцем (п. 4 ст. 161 НК РФ).
  4. Плательщик УСН владеет судном, не зарегистрированным в течение срока от 45 дней в Российском реестре (п. 6 ст. 161 НК РФ).

Как платится импортный НДС упрощенцем?

Вне зависимости от того, имеет ли иностранный поставщик представительства в России или нет, упрощенец платит НДС при импорте не относящихся к поименованным в ст. 150 НК РФ:

  1. Товаров из других государств ЕАЭС.

Уплачиваются и декларируются такие товары не позднее 20 числа месяца, что идет за тем, в котором осуществлен импорт. Получатель декларации и налога — ФНС.

  1. Товары из стран, не входящих в ЕАЭС.

НДС по ним платится в момент ввоза через границу. Получатель платежа — таможенная служба (ФТС).

Кроме того, упрощенец, находясь в России, может покупать товары или услуги у иностранного поставщика, не поставленного на налоговый учет в РФ (пп. 1, 2 ст. 161 НК РФ). Отметим, что в данном случае российский налогоплательщик на УСН получает статус налогового агента (как и посредник). Но те правоотношения, в которых он участвует, по существу относятся к международной торговле, к сфере импорта.

Налог на товары у поставщика, не стоящего на учете в РФ, фирма на УСН исчисляет самостоятельно и уплачивает до 25 числа месяца, следующего за отчетным кварталом. В свою очередь, НДС на услуги удерживает и перечисляет непосредственно при расчетах с поставщиком (п. 4 ст. 174 НК РФ).

Декларация по НДС на «агентские» товары и услуги подается до 25 числа месяца, что идет за кварталом, в котором совершены операции по закупке товаров и услуг у иностранных поставщиков (п. 5 ст. 174 НК РФ).

Итак, мы изучили, кто платит НДС при упрощенной системе налогообложения и каким образом. Но есть еще один важный нюанс работы упрощенца с налогом, о котором идет речь, — его восстановление при переходе на УСН.

Можно ли не восстанавливать НДС при переходе на УСН?

Если фирма перешла с ОСН на упрощенку — как работать с НДС в этом случае?

Если хозяйствующий субъект, изначально работающий на ОСН, переходит на УСН, то НДС, принятый к вычету к тому моменту, должен быть восстановлен и уплачен в бюджет.

В общем случае восстановление идет по суммам, соответствующим величине оформленных вычетов. Но если НДС до того принимался к вычету по основным фондам и нематериальным активам, то их необходимо восстановить в величине, которая пропорциональна их остаточной стоимости.

ООО «Трейдинг-Консалтинг» закупило сервер на 300 000 рублей, плюс НДС — 54 000 рублей и приняло его к вычету.

За период полезного использования стоимость компьютера уменьшилась вдвое — до 150 000 рублей. И если ООО «Трейдинг-Консалтинг» перейдет в этот момент на УСН, то оно должно будет восстановить вдвое меньший НДС — 27 000 рублей.

НДС должен быть восстановлен в квартале, который предшествует переходу с ОСН на УСН. Как только НДС восстановлен и уплачен, то его упрощенец вправе включить в состав расходов при исчислении налоговой базы при УСН «доходы минус расходы».

В общем случае хозяйственные операции при упрощенной системе налогообложения НДС не облагаются. Но фирмы и ИП на УСН вправе выставить счет-фактуру с выделенным НДС или вступить в правоотношения (например, связанные с импортом товаров или услуг), обуславливающие появление у них обязанности по исчислению и уплате налога.

НДС при УСН (6%)

Письмо Министерства финансов РФ № 03-11-11/280 от 21.09.2012

Департамент налоговой и таможенно-тарифной политики по вопросу применения индивидуальным предпринимателем упрощенной системы налогообложения сообщает следующее.

В соответствии с подпунктом 1 пункта 5 статьи 173 Налогового кодекса РФ (далее — Кодекс) в случае выставления лицами, не являющимися налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, или налогоплательщиками, освобожденными от исполнения обязанностей налогоплательщиков данного налога, покупателю товаров (работ, услуг) счета-фактуры с выделением суммы налога на добавленную стоимость вся сумма налога на добавленную стоимость, указанная в данном счете-фактуре, подлежит уплате в бюджет.

Согласно пункту 2 статьи 346.11 Кодекса организации и индивидуальные предприниматели, применяющие упрощенную систему налогообложения, не являются налогоплательщиками налога на добавленную стоимость, за исключением налога на добавленную стоимость, подлежащего уплате в соответствии с Кодексом при ввозе товаров на таможенную территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией, а также налога на добавленную стоимость, уплачиваемого в соответствии со статьей 174.1 Кодекса.

Как установлено статьей 346.15 Кодекса, налогоплательщиками, применяющими упрощенную систему налогообложения, учет доходов от реализации товаров (работ, услуг) и имущественных прав осуществляется в порядке, установленном статьей 249 Кодекса, а внереализационных доходов — в порядке, установленном статьей 250 Кодекса. При этом не учитываются доходы, предусмотренные статьей 251 Кодекса.

В соответствии с пунктом 2 статьи 249 Кодекса доходы от реализации товаров (работ, услуг) и имущественных прав определяются исходя из всех поступлений, связанных с расчетами за реализованные товары (работы, услуги) или имущественные права, выраженные в денежной и (или) натуральной формах.

Статьями 249 и 251 Кодекса не предусмотрено уменьшение доходов от реализации товаров (работ, услуг) и имущественных прав на сумму налога на добавленную стоимость, уплаченную в порядке, установленном подпунктом 1 пункта 5 статьи 173 Кодекса.

Налогоплательщики, применяющие вышеназванный специальный налоговый режим, выбравшие в качестве объекта налогообложения доходы, уменьшенные на величину расходов, при определении налоговой базы учитывают расходы, предусмотренные пунктом 1 статьи 346.16 Кодекса. Данный перечень расходов является исчерпывающим.

На основании подпункта 22 пункта 1 статьи 346.16 Кодекса полученные доходы уменьшаются налогоплательщиками на суммы налогов и сборов, уплаченных в соответствии с законодательством Российской Федерации о налогах и сборах. В этой связи при исчислении налоговой базы в составе расходов, уменьшающих доходы, должны учитываться суммы только тех налогов и сборов, от уплаты которых налогоплательщики, применяющие упрощенную систему налогообложения, не освобождены.

Учитывая изложенное, суммы налога на добавленную стоимость, выделенные в счетах-фактурах, выставленных покупателям товаров (работ, услуг) налогоплательщиками, применяющими упрощенную систему налогообложения, и уплаченные ими в бюджет, при определении налоговой базы в составе расходов не учитываются.

Заместитель директора департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Министерства финансов РФ С.В. Разгулин

НДС при УСН

В каких ситуациях у «освобожденных» от НДС «упрощенщиков» появляется обязанность по декларированию и уплате в бюджет этого налога? Нужно ли в таком случае учитывать НДС в доходах и можно ли получить налоговый вычет по нему? На эти вопросы ответит Наталья Горбова, руководитель направления обучения налоговому учету и отчетности Контур.Школы.

Компании на упрощенной системе налогообложения освобождены от уплаты ряда налогов. Наиболее привлекательным является освобождение от уплаты НДС. Однако сегодня нельзя говорить о полном отстранении «упрощенца» от этого налога. Бывают ситуации, в которых и «упрощенцы» являются налоговыми агентами по НДС, должны перечислять НДС в бюджет, а также представлять декларацию по НДС или Журнал учета полученных и выставленных счетов-фактур. При этом компания на УСН не является плательщиком НДС, а это значит, что права на налоговый вычет по «входному» НДС не имеет.

«Упрощенец» — налоговый агент по НДС

Компании на УСН освобождены от обязанностей плательщика НДС, однако у них могут возникать обязанности налоговых агентов по этому налогу (п. 5 ст. 346.11 НК РФ). «Упрощенцы» выступают в качестве налоговых агентов в следующих случаях:

  • когда арендуют государственное или муниципальное имущество у органов государственной власти и управления, органов местного самоуправления;
  • когда приобретают товары (работы, услуги), местом реализации которых является территория РФ, у иностранных лиц, которые не состоят на учете в налоговых органах РФ;
  • когда в качестве посредника с участием в расчетах реализуют товары (работы, услуги, имущественные права) иностранных лиц, которые не состоят на учете в налоговых органах РФ;
  • когда покупают (получают) государственное или муниципальное имущество, не закрепленное за государственными (муниципальными) предприятиями и учреждениями;
  • когда продают конфискованное или реализуемое по решению суда имущество, бесхозяйные ценности, клады и скупленные ценности, а также ценности, которые перешли по праву наследования государству;
  • в иных случаях, указанных в ст. 161 НК РФ.

Рассмотрим подробнее первые две ситуации.

Арендуется госимущество

Когда «упрощенцы» арендуют государственное или муниципальное имущество у органов государственной власти и управления, органов местного самоуправления (кроме МУПа, ГУПа, учреждения), они становятся налоговыми агентами по НДС. Ставка налога в этом случае зависит от условий договора.

Если в договоре аренды НДС не выделен, тогда сумма налога рассчитывается по формуле:

НДС с суммы арендной платы = Сумма арендной платы × 18 %

При этом органу власти арендная плата перечисляется в сумме, указанной в договоре аренды, а НДС арендатор уплачивает «за свой счет».

Если в договоре сумма НДС выделена, тогда налог рассчитывается по расчетной ставке по формуле:

НДС с суммы арендной платы = Сумма арендной платы × 18/118

Сумма арендной платы, установленная в договоре, перечисляется арендодателю за минусом НДС. В такой ситуации налог действительно уплачивается из средств арендодателя.

«Упрощенец»-арендатор должен составить счет-фактуру в одном экземпляре и оставить его у себя. Налог уплачивается по 1/3 суммы налога не позднее 25-го числа каждого из трех месяцев, следующих за отчетным кварталом. В том квартале, когда налог был перечислен в бюджет, «упрощенец» вправе учесть НДС в расходах (пп. 8 п. 1 ст. 346.16 НК РФ).

Организация ООО «Х» является плательщиком УСН. Осуществляет розничную торговлю. Под магазин арендует у комитета по управлению имуществом помещение, находящееся в муниципальной собственности. Согласно договору аренды ежемесячная арендная плата составляет 118 000 руб. (в том числе НДС — 18 000 руб.). Арендная плата перечисляется не позднее 3 числа месяца, следующего за расчетным. Таким образом, НДС с арендной платы составляет 18 000 руб. Организация ООО «Х» выступает в роли налогового агента, а значит, должна исчислить, удержать и перечислить НДС с суммы арендной платы в бюджет. При этом арендодателю будет перечислено 100 000 руб.

Приобретаются товары или услуги у иностранцев

Компания на УСН признается налоговым агентом по НДС, если приобретает у иностранных лиц, которые не состоят на учете в налоговых органах РФ, товары (работы, услуги), местом реализации которых является территория РФ. Налоговая база по таким операциям определяется налоговым агентом.

В I квартале 2015 года польская компания «Y» оказала организации ООО «Ромашка» юридические услуги. Стоимость услуг с учетом налогов, подлежащих удержанию в соответствии с законодательством РФ, — 236 000 руб. Иностранная компания не имеет на территории РФ представительства. Акт сдачи-приемки оказанных услуг подписан в I квартале 2015 года. Все расчеты произведены в рублях. Таким образом, организация ООО «Ромашка» является налоговым агентом и обязана исчислить, удержать и перечислить НДС с суммы оплаты услуг в бюджет: 36 000 руб. (236 000 × 18/118).

Обязанность заплатить НДС

Несмотря на то что «упрощенцы» не являются плательщиками НДС, в ряде случаев у них возникает обязанность заплатить налог в бюджет. Рассмотрим некоторые из них подробнее.

Ввозятся товары

Ввоз товаров на территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией, согласно ст. 146 НК РФ является объектом налогообложения. В этом случае и компании на УСН должны заплатить НДС (п. 2, 3 ст. 346.11 НК РФ). Здесь есть особенность по срокам уплаты НДС. Так, согласно общим правилам, сроки уплаты НДС при ввозе товаров зависят от таможенной процедуры, под которую помещаются товары (ст. 82 ТК ТС):

  • При выпуске товаров для внутреннего потребления налог уплачивается до их выпуска (п. 3 ст. 211 ТК ТС).
  • Если товары помещены под таможенную процедуру временного ввоза (допуска), НДС уплачивается до выпуска товаров в соответствии с указанной таможенной процедурой при уплате всей суммы ввозных таможенных пошлин, налогов, подлежащих уплате за установленный срок временного ввоза (п. 3 ст. 283 ТК ТС) и др.

Кроме того, таможенное законодательство предусматривает в ряде случаев специальные сроки уплаты НДС.

В общем случае сумма НДС, которую необходимо уплатить в бюджет при ввозе товаров на таможенную территорию РФ, определяется по формулам:

НДС = Налоговая база × Ставка

Налоговая база = Таможенная стоимость + Таможенная пошлина + Акциз

Ставка НДС применяется в зависимости от вида товаров: 10 или 18 %. НДС, подлежащий уплате в бюджет, исчисляется в российских рублях и округляется до второго знака после запятой.

При ввозе товаров из государств — членов Евразийского экономического союза, сумма НДС, подлежащая уплате, определяется по формуле:

НДС = (Цена сделки + Акциз) × 18 % (или 10 %)

В этой ситуации налог уплачивается в срок не позднее 20 числа месяца, следующего за месяцем, в котором товары приняты к учету.

Выставляется счет-фактура с выделенным НДС

Когда «упрощенцы» выставляют счет-фактуру, в том числе по авансовому платежу, с выделенным в нем НДС, они должны перечислить НДС в бюджет (п. 5 ст. 173 НК РФ). Также в данном случае у компании на УСН возникает дополнительная обязанность — представить декларацию по НДС. Отчитываться по этому налогу нужно в электронном виде по ТКС не позднее 25 числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом.

Кроме того, если «упрощенцы»-посредники выставляют и (или) получают счета-фактуры при осуществлении деятельности в интересах другого лица, они обязаны вести Журналы учета полученных и выставленных счетов-фактур (п. 3.1 ст. 169 НК РФ).

Комиссионеры и агенты, действующие от своего имени, а также лица, осуществляющие деятельность на основе договоров транспортной экспедиции в интересах других лиц и учитывающие вознаграждения при исполнении этих договоров в составе доходов по УСН, должны вести Журнал учета полученных и выставленных счетов-фактур.

При этом, если «упрощенцы» реализуют или приобретают товары, работы или услуги от своего имени, они не должны уплатить НДС. В этой ситуации возникает обязанность выставлять (перевыставлять) счета-фактуры, выделяя в них сумму НДС (п. 1 ст. 169 НК РФ).

Осуществляются операции по договорам товариществ

Компании на УСН должны заплатить НДС в бюджет, если осуществляются операции по договору простого товарищества (договору о совместной деятельности), договору инвестиционного товарищества, договорам доверительного управления имуществом или концессионным соглашениям на территории РФ (ст. 174.1, ст. 346.11 НК РФ). Кроме того, в этой ситуации «упрощенцы» должны подать в налоговый орган декларацию по НДС не позднее 25 числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом (п. 5 ст. 174, п. 4 ст. 174.1 НК РФ).

Обязанность составлять счета-фактуры

Помимо обязанности уплатить НДС в бюджет, у «упрощенцев», которые осуществляют операции по договорам товариществ (см. ст. 174.1 НК РФ), может возникнуть обязанность составить счет-фактуру. Приведем примеры таких ситуаций. Компания как комиссионер (агент, действующий от своего имени) получает аванс или отгружает товары (работы, услуги) комитента (принципала) — плательщика НДС. Либо компания как посредник, участвующий в расчетах, отгружает товары (работы, услуги) иностранного лица, не состоящего на налоговом учете в РФ, или получает за них аванс. Счет-фактура в этих ситуациях выписывается в двух экземплярах, один из которых передается покупателю.

Кроме того, счет-фактура в обязательном порядке составляется, если «упрощенец» как комиссионер (агент, действующий от своего имени) перечислил аванс или получил товары (работы, услуги), приобретенные для комитента (принципала) у продавца — плательщика НДС. И в этом случае счет-фактура составляется в двух экземплярах, один из которых передается комитенту (принципалу).

Кодексом предусмотрены и другие ситуации, вынуждающие плательщиков УСН знать свои обязанности по НДС.

Можно ли избежать двойного налогообложения?

В некоторых случаях при уплате НДС в бюджет у компаний на УСН возникает двойное налогообложение, когда суммы НДС включаются в доходы от реализации и одновременно облагаются единым «упрощенным» налогом. Например, когда в договоре аренды госимущества не выделен НДС и арендная плата перечисляется в сумме, указанной в договоре, а НДС арендатор на УСН уплачивает «за свой счет». Или когда плательщик УСН выставляет счет-фактуру с выделенным НДС, сумму которого он перечисляет в бюджет (п. 5 ст. 173 НК РФ).

Однако с 2016 года плательщики УСН и ЕСХН, выставляющие счета-фактуры, не должны будут учитывать НДС в доходах. Соответствующие поправки в Налоговый кодекс внесены Федеральным законом от 06.04.15 № 84-ФЗ. Данный закон исключает из состава выручки при УСН и ЕСХН суммы НДС, полученные при выставлении счетов-фактур с выделенной суммой налога. Также в законе прямо прописано, что суммы НДС, которые уплачены в бюджет по счетам-фактурам, выставленным покупателям, не включаются в расходы при исчислении ЕСХН и УСН. Подробнее об этом читайте здесь.

Как ИП на УСН (6%) и ЕНВД учитывать НДС при работе с UBER?

Подаете декларацию по НДС, как налоговый агент.
При этом заполняте титульный лист и раздел 2.

Читаем первоисточник:
При исполнении обязанности налогового агента организациями и индивидуальными предпринимателями, не являющимися налогоплательщиками налога в связи с переходом на систему налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей в соответствии с главой 26.1 Кодекса, на упрощенную систему налогообложения в соответствии с главой 26.2 Кодекса, на систему налогообложения в виде единого налога на вмененный доход для отдельных видов деятельности в соответствии с главой 26.3 Кодекса, или на патентную систему налогообложения в соответствии с главой 26.5 Кодекса заполняются титульный лист и раздел 2 декларации. При отсутствии показателей для заполнения раздела 1 декларации в строках указанного раздела ставятся прочерки. При этом в титульном листе по реквизиту «по месту нахождения (учета)» указывается код «231».

Срок подачи декларации — до 25 числа месяца, следующего за отчетным кварталом.

Вот этого я не понял.
Поскольку Вы не плательщик НДС, а только налоговый агент, для Вас нет ни «входящего», ни «исходящего» НДС. Вы платите НДС за Убер, а не за себя.
Соответственно, никаких вычетов по НДС у Вас не должно быть.